Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms