Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FANCLQ9NW38 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FANCLQ9NW38 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms