Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LRRIQ1Q96JM4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LRRIQ1Q96JM4 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms