Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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