Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NLRC3Q7RTR2 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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