| CTXN3 | Q4LDR2 | AL080274.1-201 | ENST00000605565 | 220 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC034238.1-213 | ENST00000611148 | 150 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC026523.1-201 | ENST00000617221 | 490 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090971.5-201 | ENST00000621102 | 293 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CEP57-213 | ENST00000541150 | 2911 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR369-201 | ENST00000362155 | 70 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-62P-201 | ENST00000362599 | 164 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.179-201 | ENST00000363844 | 90 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.197-201 | ENST00000364004 | 102 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-879P-201 | ENST00000364328 | 108 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.332-201 | ENST00000365271 | 113 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-281P-201 | ENST00000384212 | 103 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA64-201 | ENST00000384674 | 134 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGN2P39-201 | ENST00000398005 | 273 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1283-1-201 | ENST00000408494 | 87 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC123900.1-201 | ENST00000420390 | 96 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND4P28-201 | ENST00000426217 | 387 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC016925.1-201 | ENST00000458303 | 298 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4753-201 | ENST00000585119 | 83 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC010999.1-201 | ENST00000611856 | 324 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Clostridiales-1.2-201 | ENST00000636724 | 160 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SMARCAD1-201 | ENST00000354268 | 4912 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.813-201 | ENST00000364639 | 102 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-793P-201 | ENST00000384233 | 104 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.592-201 | ENST00000410274 | 109 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1001P-201 | ENST00000411265 | 100 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS20P15-201 | ENST00000412792 | 311 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091179.3-201 | ENST00000474761 | 144 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UBL5P3-201 | ENST00000475112 | 231 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC125232.2-201 | ENST00000592457 | 143 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MZT1P2-201 | ENST00000604387 | 248 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC018692.1-202 | ENST00000623559 | 676 nt | TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC131280.1-202 | ENST00000624067 | 4211 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ARHGAP5-202 | ENST00000345122 | 9604 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRKACB-204 | ENST00000370685 | 4481 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.5-201 | ENST00000362334 | 102 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC096644.2-201 | ENST00000429278 | 159 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC9P-201 | ENST00000516210 | 116 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP200-201 | ENST00000516360 | 103 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091144.1-201 | ENST00000519573 | 138 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CR936218.1-201 | ENST00000570454 | 304 nt | TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC020910.1-201 | ENST00000599404 | 413 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KTN1-214 | ENST00000554507 | 2057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ANKRD36-208 | ENST00000639751 | 3090 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD114-1-201 | ENST00000362705 | 72 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA67.3-201 | ENST00000384366 | 140 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR504-201 | ENST00000385065 | 83 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NPS-201 | ENST00000398023 | 270 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC139712.2-201 | ENST00000424302 | 339 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PLCB1-IT1-201 | ENST00000441231 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01032-201 | ENST00000451690 | 276 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CFAP100-207 | ENST00000510833 | 481 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.683-201 | ENST00000516508 | 93 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-826P-201 | ENST00000516827 | 104 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359314.1-201 | ENST00000616913 | 261 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009831.4-201 | ENST00000620744 | 325 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR7843-201 | ENST00000622274 | 79 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC130454.1-201 | ENST00000622948 | 401 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02555-201 | ENST00000563933 | 1951 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FGF7-201 | ENST00000267843 | 5467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR6073-201 | ENST00000352083 | 89 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP361-201 | ENST00000362686 | 118 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.252-201 | ENST00000364556 | 101 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-42P-201 | ENST00000364738 | 142 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD42.2-201 | ENST00000365570 | 69 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.394-201 | ENST00000383942 | 103 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.415-201 | ENST00000384012 | 112 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.496-201 | ENST00000384444 | 101 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-160P-201 | ENST00000384591 | 107 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR586-201 | ENST00000385035 | 97 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR628-201 | ENST00000385229 | 95 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL079342.1-201 | ENST00000401460 | 267 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC110995.1-201 | ENST00000444185 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGN2P9-201 | ENST00000476875 | 229 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA16.3-201 | ENST00000516595 | 184 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR2355-201 | ENST00000517199 | 87 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |