Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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