Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ME3Q16798 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ME3Q16798 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ME3Q16798 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ME3Q16798 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms