Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SGCAQ16586 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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