Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VPS72Q15906 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms