Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SYCP1Q15431 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SYCP1Q15431 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SYCP1Q15431 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SYCP1Q15431 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SYCP1Q15431 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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SYCP1Q15431 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SYCP1Q15431 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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