Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PUM3Q15397 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PUM3Q15397 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms