Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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