Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMCO1Q147U7 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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