Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SEMA3AQ14563 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3AQ14563 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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