Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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COL4A6Q14031 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
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COL4A6Q14031 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
COL4A6Q14031 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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COL4A6Q14031 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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COL4A6Q14031 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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COL4A6Q14031 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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COL4A6Q14031 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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COL4A6Q14031 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
COL4A6Q14031 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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