Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGB1Q14028 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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