Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALCAMQ13740 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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