Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PICALMQ13492 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PICALMQ13492 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PICALMQ13492 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PICALMQ13492 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PICALMQ13492 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PICALMQ13492 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PICALMQ13492 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms