Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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