Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
MSLNQ13421 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms