Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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