Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SRSF6Q13247 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms