Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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CALCOCO2Q13137 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CALCOCO2Q13137 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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CALCOCO2Q13137 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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