Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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HMGXB3Q12766 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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HMGXB3Q12766 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGXB3Q12766 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGXB3Q12766 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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