Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
EPHB4P54760 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms