Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERFP50548 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERFP50548 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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