Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMPOP42166 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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