Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SOBPA7XYQ1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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