Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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