Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRHQ9HD43 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms