Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTXN3Q4LDR2 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms