Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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LAMA3Q16787 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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LAMA3Q16787 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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LAMA3Q16787 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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LAMA3Q16787 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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