| MAPKAPK3 | Q16644 | MTND4P1-201 | ENST00000457501 | 1466 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORA4.4-201 | ENST00000515921 | 135 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.683-201 | ENST00000516508 | 93 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-344P-201 | ENST00000516635 | 111 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP002770.2-201 | ENST00000543613 | 532 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC004486.1-201 | ENST00000546846 | 233 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC022469.2-201 | ENST00000554759 | 396 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR4672-201 | ENST00000583126 | 81 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR4635-201 | ENST00000583759 | 79 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | GPR22-201 | ENST00000304402 | 2942 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC062016.1-201 | ENST00000355719 | 319 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.326-201 | ENST00000365176 | 113 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR329-1-201 | ENST00000385028 | 80 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | MZT1P2-201 | ENST00000604387 | 248 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL353621.2-201 | ENST00000605340 | 133 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC007742.2-201 | ENST00000618226 | 398 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ETDC-201 | ENST00000635820 | 180 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | PRKACB-204 | ENST00000370685 | 4481 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-545P-201 | ENST00000362681 | 104 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU1-112P-201 | ENST00000364401 | 164 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD31B-201 | ENST00000364977 | 69 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD14.1-201 | ENST00000365609 | 90 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.422-201 | ENST00000384054 | 114 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-639P-201 | ENST00000384074 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-708P-201 | ENST00000384217 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-318P-201 | ENST00000384283 | 103 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.526-201 | ENST00000384572 | 110 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AFDN-AS1-202 | ENST00000417244 | 182 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL109933.2-201 | ENST00000452651 | 260 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC112492.4-201 | ENST00000456549 | 352 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | HMGB3P3-201 | ENST00000510526 | 400 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-991P-201 | ENST00000516168 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CR936218.1-201 | ENST00000570454 | 304 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC022809.1-201 | ENST00000579247 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC025754.2-201 | ENST00000606491 | 432 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SLC6A15-202 | ENST00000309283 | 3108 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | UHMK1-204 | ENST00000545294 | 8117 nt | TSL 2 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.158-201 | ENST00000363651 | 101 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1145P-201 | ENST00000384246 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORA51.11-201 | ENST00000384442 | 131 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP210-201 | ENST00000391034 | 120 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP21-201 | ENST00000410917 | 96 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC110995.1-201 | ENST00000444185 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC012312.1-201 | ENST00000503710 | 527 nt | TSL 2 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP82-201 | ENST00000516707 | 92 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CYCSP23-201 | ENST00000519781 | 313 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | LINC02104-202 | ENST00000604954 | 599 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SCOC-AS1-203 | ENST00000609616 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR203B-201 | ENST00000636080 | 86 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ZNF271P-202 | ENST00000465539 | 1970 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | DNAH7-201 | ENST00000312428 | 12394 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.389-201 | ENST00000383924 | 113 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-926P-201 | ENST00000384075 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR9-1-201 | ENST00000385198 | 89 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-101P-201 | ENST00000410323 | 104 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | LINC02532-205 | ENST00000430094 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC091133.1-201 | ENST00000435491 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |