Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCBQ16585 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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