Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SSX2Q16385 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSX2Q16385 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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