Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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SNCBQ16143 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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SNCBQ16143 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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SNCBQ16143 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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SNCBQ16143 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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