Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK4Q16099 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms