Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USF2Q15853 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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USF2Q15853 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
USF2Q15853 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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