Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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