Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ALX1Q15699 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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ALX1Q15699 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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ALX1Q15699 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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ALX1Q15699 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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ALX1Q15699 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ALX1Q15699 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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