Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SEC23AQ15436 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SEC23AQ15436 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SEC23AQ15436 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SEC23AQ15436 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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