Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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SYCP1Q15431 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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