Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB35Q15286 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms