Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDK3Q15120 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms