Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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