Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CAPRIN1Q14444 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms