Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARB2Q14108 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARB2Q14108 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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