Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
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