Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL4AQ13619 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms